Sjeme slobode govori o sjemenkama, od njihovih korijena u srcu tradicionalnih i raznolikih sustava uzgoja širom svijeta, do njihove transformacije u moćnu robu koja se koristi za monopoliziranje globalnog prehrambenog sustava.
Film naglašava u kojoj je mjeri industrijski poljoprivredni sustav, a posebno genetski modificirano sjeme, utjecao na ogromnu agrobiološku raznolikost koju su poljoprivrednici i zajednice širom svijeta razvili od početka poljoprivrede.
Sjeme slobode želi osporiti mantru da je industrijska poljoprivreda u velikim razmjerima jedino sredstvo kojim možemo prehraniti svijet, promovirano od pro-GMO grupe. Slijedeći povijest sjemena, jasno se vidi kako je dnevni red tvrtki doveo do preuzimanja sjemena, kako bi se postigle velike koristi i kontrola nad svjetskim prehrambenim sustavom.
